A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture - Campus AAR Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Genome Research Année : 2015

A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture

Monika Karmin , Lauri Saag , Mário Vicente , Melissa Wilson Sayres , Mari Järve , Ulvi Gerst Talas , Siiri Rootsi (1) , Anne-Mai Ilumäe , Reedik Mägi , Mario Mitt , Luca Pagani , Tarmo Puurand , Zuzana Faltyskova , Florian Clemente , Alexia Cardona , Ene Metspalu (2) , Hovhannes Sahakyan , Bayazit Yunusbayev , Georgi Hudjashov , Michael Degiorgio , Eva-Liis Loogväli , Chris Eichstaedt , Mikk Eelmets , Gyaneshwer Chaubey , Kristiina Tambets , Sergei Litvinov , Maru Mormina (3) , Yali Xue (4) , Qasim Ayub , Grigor Zoraqi , Thorfinn Sand Korneliussen , Farida Akhatova , Joseph Lachance , Sarah Tishkoff (5) , Kuvat Momynaliev , François-Xavier Ricaut (6, 7) , Pradiptajati Kusuma (8) , Harilanto Razafindrazaka (9) , Denis Pierron (8) , Murray Cox , Gazi Nurun Nahar Sultana , Rane Willerslev , Craig Muller , Michael Westaway , David Lambert (10) , Vedrana Skaro , Lejla Kovačevic , Shahlo Turdikulova , Dilbar Dalimova , Rita Khusainova , Natalya Trofimova , Vita Akhmetova , Irina Khidiyatova , Daria Lichman , Jainagul Isakova (11) , Elvira Pocheshkhova , Zhaxylyk Sabitov , Nikolay Barashkov , Pagbajabyn Nymadawa (12) , Evelin Mihailov , Joseph Wee Tien Seng , Irina Evseeva (13) , Andrea Migliano , Syafiq Abdullah , George Andriadze , Dragan Primorac , Lubov Atramentova , Olga Utevska , Levon Yepiskoposyan , Damir Marjanovic , Alena Kushniarevich , Doron Behar , Chris Gilissen , Lisenka Vissers (14) , Joris A Veltman (15) , Elena Balanovska , Miroslava Derenko , Boris Malyarchuk , Andres Metspalu (16) , Sardana Fedorova , Anders Eriksson (17) , Andrea Manica , Fernando Méndez (18) , Tatiana Karafet , Krishna Veeramah , Neil Bradman , Michael Hammer , Ludmila Osipova (19) , Oleg Balanovsky (20) , Elza K. Khusnutdinova (21) , Knut Johnsen , Maido Remm , Mark Thomas , Chris Tyler-Smith (22) , Peter Underhill (23) , Eske Willerslev (24) , Rasmus Nielsen (25) , Mait Metspalu (2) , Richard Villems (26) , Toomas Kivisild (3) , Melissa Sayres , Mari Mitt , Christina Eichstaedt , Lejla Kovačevic´ , Joseph Seng , Andrea Bamberg Migliano , Damir Marjanovic´ , Christian Gilissen (15)
Monika Karmin
  • Fonction : Auteur
Lauri Saag
  • Fonction : Auteur
Mário Vicente
  • Fonction : Auteur
Melissa Wilson Sayres
  • Fonction : Auteur
Mari Järve
  • Fonction : Auteur
Ulvi Gerst Talas
  • Fonction : Auteur
Anne-Mai Ilumäe
  • Fonction : Auteur
Reedik Mägi
  • Fonction : Auteur
Mario Mitt
  • Fonction : Auteur
Luca Pagani
  • Fonction : Auteur
Tarmo Puurand
  • Fonction : Auteur
Zuzana Faltyskova
  • Fonction : Auteur
Florian Clemente
  • Fonction : Auteur
Alexia Cardona
  • Fonction : Auteur
Ene Metspalu
  • Fonction : Auteur
Hovhannes Sahakyan
  • Fonction : Auteur
Bayazit Yunusbayev
  • Fonction : Auteur
Georgi Hudjashov
  • Fonction : Auteur
Michael Degiorgio
  • Fonction : Auteur
Eva-Liis Loogväli
  • Fonction : Auteur
Chris Eichstaedt
  • Fonction : Auteur
Mikk Eelmets
  • Fonction : Auteur
Gyaneshwer Chaubey
  • Fonction : Auteur
Kristiina Tambets
  • Fonction : Auteur
Sergei Litvinov
  • Fonction : Auteur
Yali Xue
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 913358
Qasim Ayub
  • Fonction : Auteur
Grigor Zoraqi
  • Fonction : Auteur
Thorfinn Sand Korneliussen
  • Fonction : Auteur
Farida Akhatova
  • Fonction : Auteur
Joseph Lachance
  • Fonction : Auteur
Kuvat Momynaliev
  • Fonction : Auteur
Murray Cox
  • Fonction : Auteur
Gazi Nurun Nahar Sultana
  • Fonction : Auteur
Rane Willerslev
  • Fonction : Auteur
Craig Muller
  • Fonction : Auteur
Michael Westaway
  • Fonction : Auteur
Vedrana Skaro
  • Fonction : Auteur
Lejla Kovačevic
  • Fonction : Auteur
Shahlo Turdikulova
  • Fonction : Auteur
Dilbar Dalimova
  • Fonction : Auteur
Rita Khusainova
  • Fonction : Auteur
Natalya Trofimova
  • Fonction : Auteur
Vita Akhmetova
  • Fonction : Auteur
Irina Khidiyatova
  • Fonction : Auteur
Daria Lichman
  • Fonction : Auteur
Elvira Pocheshkhova
  • Fonction : Auteur
Zhaxylyk Sabitov
  • Fonction : Auteur
Nikolay Barashkov
  • Fonction : Auteur
Evelin Mihailov
  • Fonction : Auteur
Joseph Wee Tien Seng
  • Fonction : Auteur
Andrea Migliano
  • Fonction : Auteur
Syafiq Abdullah
  • Fonction : Auteur
George Andriadze
  • Fonction : Auteur
Dragan Primorac
  • Fonction : Auteur
Lubov Atramentova
  • Fonction : Auteur
Olga Utevska
  • Fonction : Auteur
Levon Yepiskoposyan
  • Fonction : Auteur
Damir Marjanovic
  • Fonction : Auteur
Alena Kushniarevich
  • Fonction : Auteur
Doron Behar
  • Fonction : Auteur
Chris Gilissen
  • Fonction : Auteur
Lisenka Vissers
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 909021
Elena Balanovska
  • Fonction : Auteur
Miroslava Derenko
  • Fonction : Auteur
Boris Malyarchuk
  • Fonction : Auteur
Sardana Fedorova
  • Fonction : Auteur
Andrea Manica
Tatiana Karafet
  • Fonction : Auteur
Krishna Veeramah
  • Fonction : Auteur
Neil Bradman
  • Fonction : Auteur
Michael Hammer
  • Fonction : Auteur
Knut Johnsen
  • Fonction : Auteur
Maido Remm
  • Fonction : Auteur
Mark Thomas
Chris Tyler-Smith
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 913363
Melissa Sayres
  • Fonction : Auteur
Mari Mitt
  • Fonction : Auteur
Christina Eichstaedt
  • Fonction : Auteur
Lejla Kovačevic´
  • Fonction : Auteur
Joseph Seng
  • Fonction : Auteur
Andrea Bamberg Migliano
  • Fonction : Auteur
Damir Marjanovic´
  • Fonction : Auteur

Résumé

It is commonly thought that human genetic diversity in non-African populations was shaped primarily by an out-of-Africa dispersal 50-100 thousand yr ago (kya). Here, we present a study of 456 geographically diverse high-coverage Y chromosome sequences, including 299 newly reported samples. Applying ancient DNA calibration, we date the Y-chromosomal most recent common ancestor (MRCA) in Africa at 254 (95% CI 192-307) kya and detect a cluster of major non-African founder haplogroups in a narrow time interval at 47-52 kya, consistent with a rapid initial colonization model of Eurasia and Oceania after the out-of-Africa bottleneck. In contrast to demographic reconstructions based on mtDNA, we infer a second strong bottleneck in Y-chromosome lineages dating to the last 10 ky. We hypothesize that this bottleneck is caused by cultural changes affecting variance of reproductive success among males.
Fichier principal
Vignette du fichier
Genome Res.-2015-Karmin-459-66.pdf (12.94 Mo) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte
Loading...

Dates et versions

hal-02112784 , version 1 (01-10-2019)

Identifiants

Citer

Monika Karmin, Lauri Saag, Mário Vicente, Melissa Wilson Sayres, Mari Järve, et al.. A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture. Genome Research, 2015, 25 (4), pp.459-466. ⟨10.1101/gr.186684.114⟩. ⟨hal-02112784⟩
141 Consultations
60 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More